Januar 2016: Evgen Isaenko wird in die U 16 der Ukraine (Ukraine national under 16 football team) berufen. 

August 2016: Evgen Isaenko ist aktuelelr U 17 Nationalspieler der Ukraine (Ukraine national under 17 football team). 

05/2017: Evgen Isaenko nimmt für die Ukaine an der UEFA Under 17 Championship (U-17 Europameisterschaft) in Kroatien teil.

August 2017: Evgen Isaenko spelt für die U 18 der Ukraine (Ukraine national under 18 football team). 

Mai 2019: Evgen Isaenko steht in der U 19 der Ukraine (Ukraine national under 19 football team).

November 2020: Evgen Isaenko ist aktueller U 21 Nationalspieler der Ukraien (Ukraine national under 21 football team).