2006: Frano Mlinar ist U-15 Nationalspieler für Kroatien (Croatia national under 15 national team).  

2007: Frano Mlinar ist U-16 Nationalspieler für Kroatien (Croatia national under 16 national team).  

2008: Frano Mlinar ist U-17 Nationalspieler für Kroatien (Croatia national under 17 national team).  

2009: Frano Mlinar ist U-18 Nationalspieler für Kroatien (Croatia national under 18 national team).  

2010: Frano Mlinar ist U-19 Nationalspieler für Kroatien (Croatia national under 19 national team).  

07/2010: Frano Mlinar nimmt für Kroatien an der U-19 Europameisterschaft 2010 (Under 19 European Championship) in Frankreich teil. 

07/2011: Frano Mlinar nimmt für Kroatien an der U-20 Weltmeisterschaft 2011 (FIFA Under 20 World-Cup 2011) in Kolumbien teil.    

2013: Frano Mlinar ist U-21-Nationalspieler für Kroatien (Croatia national under 21 national team).